Ingénieur en analyse de données biologiques (H/F)

Job title:

Ingénieur en analyse de données biologiques (H/F)

Company:

CNRS

Job description

La personne est responsable en particulier du traitement de données immunogénétiques (immunoglobulines ou anticorps, récepteur T et protéines de la superfamille des immunoglobulines (IgSF).Activités– Définir le plan d’études et mettre en place les procédures de recueil et de contrôle des données issues des travaux de recherche en immunogénétique.
· Contribuer à l’analyse de nouveaux projets d’annotation et de biocuration et de bioinformatique au sein de l’équipe IMGT®.
· Réaliser l’analyse, l’expertise et le traitement des données de locus d’immunoglobulines et de récepteurs T (nouvelles espèces), et des protéines de la superfamille IgSF au sein de l’équipe IMGT®.
· Adapter si nécessaire les outils bioinformatiques aux besoins du projet d’annotation et de biocuration, de la mise en forme et du stockage des données.
· Alimenter les bases de données et contrôler leurs cohérences.
· Créer, modifier les pages Web dans le domaine
· Assurer la veille technique et scientifique
· Diffuser et valoriser des résultats sous formes de rapports ou d’études à usage des communautés professionnelles et scientifiques.Compétences– Connaissance dans le domaine de l’immogénétique, de la biologie moléculaire et de l’immunoinformatique
– Comprendre et interpréter une problématique dans le domaine
– Utilisation des sites biologiques et bioinformatiques (NCBI, ENSEMBL …) et d’outils d’analyse et de recherche de données (BLAST, FASTA, ALIGN …)
– Connaître un langage de programmation orienté web (HTML, CSS …)
– Maîtriser les techniques de présentation (écrites et orales)
Connaissance des environnements Unix et Windows
– Anglais courant (lu, écrit, parlé)
– Savoirs-être: Membre d’equipeContexte de travailhttps://www.imgt.org/
L’IGH est situé sur le campus Arnaud de Villeneuve, partie prenante du programme Objectif Employeur Pro-Vélo.
Bibliographie pertinente
-Debbagh C., Folch G., Jabado-Michaloud J., Giudicelli V., Kossida S.
Deciphering Gorilla gorilla gorilla immunoglobulin loci in multiple genome assemblies and enrichment of IMGT resources.
Frontiers in Immunology, 2024, 15:1475003. doi: 10.3389/fimmu.2024.1475003.
– Sanchez Sanchez G., Emmrich S., Georga M., Papadaki A., Kossida S., Seluanov A., Gorbunova V., Vermijlen, D.
Invariant γδTCR natural killer-like effector T cells in the naked mole-rat.
Nature communications, 2024 15(1), 4248. doi: 10.1038/s41467-024-48652-z.
– Nguefack Ngoune V., Bertignac M., Georga M., Papadaki A., Albani A., Folch G., Jabado-Michaloud J., Giudicelli V., Duroux P., Lefranc MP., Kossida S.
IMGT® Biocuration and Analysis of the Rhesus Monkey IG Loci.
Vaccines (Basel). 2022 Mar 3;10(3):394. doi: 10.3390/vaccines10030394 PMID: 35335026 Free PMC article.
– Linguiti G., Kossida S., Pierri CL., Jabado-Michaloud J., Folch G., Massari S., Lefranc M-P., Ciccarese S., Antonacci R.
The T cell receptor (TRB) locus in Tursiops truncatus: From sequence to structure of the alpha/beta heterodimer in the human/dolphin comparison.
Genes (Basel). 2021 Apr 14;12(4):571. doi: 10.3390/genes12040571.PMID: 33919966 Free PMC Article.
– Pégorier P., Bertignac M., Nguefack Ngoune V., Folch G., Jabado-Michaloud J.,Giudicelli V., Duroux P., Lefranc M.-P. and Kossida S.
IMGT® Biocuration and Comparative Analysis of Bos taurus and Ovis aries TRA/TRD Loci.
Genes (Basel), 2020 Dec 28;12(1):30. doi: 10.3390/genes12010030.
– Pégorier P., Bertignac M., Chentli I., Nguefack Ngoune V., Folch G., Jabado-Michaloud J., Hadi-Saljoqi S., Giudicelli V., Duroux P., Lefranc M.-P. and Kossida S.
IMGT® biocuration and comparative study of the T cell Receptor beta locus of veterinary species based on Homo sapiens TRB.
Front. Immunol., 2020 May 5;11:821doi: 10.3389/fimmu.2020.00821.Contraintes et risquesTravail sur ordinateur

Expected salary

€2521.95 per month

Location

Montpellier

Job date

Thu, 26 Jun 2025 22:06:01 GMT

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